Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL13Q99616 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms