Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SIN3AQ96ST3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIN3AQ96ST3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms