Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TNFRSF13CQ96RJ3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF13CQ96RJ3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms