Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP47Q96K76 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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