Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC41A3Q96GZ6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms