Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms