Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG4CQ96DT6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms