Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPTQ96BT3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms