Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM54Q969K7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms