Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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USP9XQ93008 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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USP9XQ93008 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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USP9XQ93008 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
USP9XQ93008 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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USP9XQ93008 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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USP9XQ93008 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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USP9XQ93008 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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