Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRUQ92729 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRUQ92729 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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