Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC107Q8WV48 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms