Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NEDD1Q8NHV4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEDD1Q8NHV4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms