Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL22A1Q8NFW1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms