Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPC24Q8NBT2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPC24Q8NBT2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms