Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PNLDC1Q8NA58 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PNLDC1Q8NA58 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms