Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SVOPQ8N4V2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVOPQ8N4V2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms