Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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RAB11FIP4Q86YS3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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RAB11FIP4Q86YS3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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RAB11FIP4Q86YS3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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RAB11FIP4Q86YS3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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RAB11FIP4Q86YS3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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RAB11FIP4Q86YS3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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RAB11FIP4Q86YS3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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