Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PREX2Q70Z35 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PREX2Q70Z35 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms