Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HACD2Q6Y1H2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HACD2Q6Y1H2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms