Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ABRAXAS1Q6UWZ7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms