Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTR9Q6PD62 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms