Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
STRIP1Q5VSL9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms