Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOGA3Q5TF21 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms