Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEND3Q5T5X7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND3Q5T5X7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms