Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C6orf141Q5SZD1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C6orf141Q5SZD1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms