Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PERM1Q5SV97 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms