Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHYHD1Q5SRE7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms