Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SDK2Q58EX2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms