Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LACTB2Q53H82 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms