Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM259Q4ZIN3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms