Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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