Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL40Q2TBA0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms