Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSPP1Q1MSJ5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms