Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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COL24A1Q17RW2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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COL24A1Q17RW2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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COL24A1Q17RW2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL24A1Q17RW2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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