Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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NRF1Q16656 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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NRF1Q16656 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NRF1Q16656 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRF1Q16656 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRF1Q16656 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRF1Q16656 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRF1Q16656 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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NRF1Q16656 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRF1Q16656 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NRF1Q16656 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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NRF1Q16656 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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NRF1Q16656 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRF1Q16656 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRF1Q16656 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRF1Q16656 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NRF1Q16656 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRF1Q16656 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NRF1Q16656 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NRF1Q16656 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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