Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK4Q16654 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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PDK4Q16654 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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