Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTF1Q16619 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTF1Q16619 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms