Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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SGCAQ16586 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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SGCAQ16586 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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SGCAQ16586 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCAQ16586 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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