Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCBQ16585 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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