Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA4Q16363 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms