Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F4Q16254 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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