Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHRNA6Q15825 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHRNA6Q15825 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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