Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA2Q15822 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms