Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIV2LQ15477 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms