Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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PTPRKQ15262 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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PTPRKQ15262 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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PTPRKQ15262 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPRKQ15262 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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PTPRKQ15262 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPRKQ15262 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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