Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NECTIN1Q15223 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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