Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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BRD3Q15059 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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BRD3Q15059 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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BRD3Q15059 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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BRD3Q15059 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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BRD3Q15059 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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BRD3Q15059 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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BRD3Q15059 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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BRD3Q15059 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRD3Q15059 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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