Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAM2Q15035 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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