Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMCO1Q147U7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms